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    如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速?

    本文作者: 汪思穎 2017-09-19 15:21
    導(dǎo)語:如何通過消除Tensorflow的網(wǎng)絡(luò)瓶頸,實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速?

    雷鋒網(wǎng) AI科技評論按:本文作者王佐,文章首發(fā)于其知乎主頁,AI科技評論獲其授權(quán)轉(zhuǎn)載。

    在上一家公司就開始實踐打磨一個深度優(yōu)化的深度學(xué)習(xí)系統(tǒng),當(dāng)時從消除網(wǎng)絡(luò)瓶頸,非凸優(yōu)化,以及具體的深度學(xué)習(xí)算法等方面基于PaddlePaddle做了許多工作。目前公司主要深度學(xué)習(xí)算法都是跑在Tensorflow上,使用配置了GeForce GTX 1080的單機訓(xùn)練,一次完整的訓(xùn)練至少需要一周的時間,所以決定從優(yōu)化Tensorflow多機并行方面提高算力。

    • 為什么要優(yōu)化Tensorflow多機并行

    更多的數(shù)據(jù)可以提高預(yù)測性能[2],這也意味著更沉重的計算負(fù)擔(dān),未來算力將成為AI發(fā)展的最大瓶頸。在大數(shù)據(jù)時代,解決存儲和算力的方法是Scale out,在AI時代,Scale out也一定是發(fā)展趨勢,并且大數(shù)據(jù)分析任務(wù)和AI/ML任務(wù)會共享處理設(shè)備(由于AI/ML迭代收斂和容錯的特征,這兩種任務(wù)未來不太可能使用統(tǒng)一平臺),所以需要在分布式環(huán)境下優(yōu)化資源配置[3],消除性能瓶頸。雖然現(xiàn)在Tensorflow能支持多機并行分布式訓(xùn)練,但是針對復(fù)雜網(wǎng)絡(luò),其訓(xùn)練速度反而不如單臺機器[1]。目前已經(jīng)有IBM[4]和Petuum[1]分別在其深度學(xué)習(xí)系統(tǒng)PowerAI 4.0和Poseidon中實現(xiàn)多機并行線性加速,本文介紹我如何通過消除Tensorflow的網(wǎng)絡(luò)瓶頸,實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速。

    • Tensorflow分布式訓(xùn)練的網(wǎng)絡(luò)瓶頸分析

    深度學(xué)習(xí)訓(xùn)練需要海量的數(shù)據(jù),這就需要超大規(guī)模參數(shù)的網(wǎng)絡(luò)模型擬合。如果訓(xùn)練數(shù)據(jù)不足,會造成欠擬合;如果網(wǎng)絡(luò)模型參數(shù)太少,只會得到低精度的模型。目前常見網(wǎng)絡(luò)模型參數(shù)已經(jīng)上億,參數(shù)大小達(dá)到數(shù)GB。[10]中給出了訓(xùn)練數(shù)據(jù)和參數(shù)大小一些例子。

    訓(xùn)練數(shù)據(jù)和參數(shù)大小(來自[10])

    如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速?

    目前GPU已經(jīng)成為深度學(xué)習(xí)訓(xùn)練的標(biāo)配。GPU具有數(shù)量眾多計算單元和超長流水線,并且具備強大并行計算能力與浮點計算能力,可以大幅加速深度學(xué)習(xí)模型的訓(xùn)練速度,相比CPU能提供更快的處理速度、更少的服務(wù)器投入和更低的功耗。這也意味著,GPU集群上訓(xùn)練深度學(xué)習(xí)模型,迭代時間更短,參數(shù)同步更頻繁。[9]中對比了主流深度學(xué)習(xí)系統(tǒng)在CPU和GPU上的訓(xùn)練性能,可以看出GPU每次迭代的時間比CPU少2個數(shù)量級。

    CPU訓(xùn)練alexnet(來自[9])

    如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速?

    GPU訓(xùn)練alexnet(來自[9])

    如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速?

    假設(shè)每0.5秒一個迭代,每個worker每秒需要通過網(wǎng)絡(luò)傳輸?shù)拇笥?GB,即使使用10GbE,參數(shù)同步也會瞬間把網(wǎng)絡(luò)占滿。考慮到訓(xùn)練數(shù)據(jù)可能通過NFS或者HDFS加載,也會占用很多網(wǎng)絡(luò)帶寬。在一個數(shù)據(jù)分析任務(wù)和AI/ML任務(wù)混合的環(huán)境中,大數(shù)據(jù)分析任務(wù)也會消耗很多網(wǎng)絡(luò)帶寬(如shuffle操作),網(wǎng)絡(luò)延遲會更加嚴(yán)重。所以如果想以Scale out的方式提升算力,網(wǎng)絡(luò)將是最大的瓶頸。[1]中通過實驗證明,在8個節(jié)點進(jìn)行Tensorflow分布式訓(xùn)練,對于VGG19網(wǎng)絡(luò),90%的時間花在等待網(wǎng)絡(luò)傳輸上面。

    網(wǎng)絡(luò)開銷(來自[2])

    如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速?

    • 消除網(wǎng)絡(luò)瓶頸的方法(一)

    分布式深度學(xué)習(xí)可以采用BSP和SSP兩種模式。SSP通過允許faster worker使用staled參數(shù),從而達(dá)到平衡計算和網(wǎng)絡(luò)通信開銷時間的效果[8]。SSP每次迭代收斂變慢,但是每次迭代時間更短,在CPU集群上,SSP總體收斂速度比BSP更快,但是在GPU集群上訓(xùn)練,BSP總體收斂速度比SSP反而快很多[6]。

    BSP模型有個缺點,就是每次迭代結(jié)束,Worker需要發(fā)送梯度更新到PS,每次迭代開始,Worker需要從PS接收更新后的參數(shù),這會造成瞬間大量的網(wǎng)絡(luò)傳輸。參數(shù)服務(wù)器通過把參數(shù)切分成block,并且shard到多臺機器,比較AllReduce,有效利用網(wǎng)絡(luò)帶寬,降低網(wǎng)絡(luò)延遲。目前主流的深度學(xué)習(xí)系統(tǒng)(Tensorflow,Mxnet,Petuum)都選擇用參數(shù)服務(wù)器做參數(shù)同步。

    AllReduce(來自[5])

    如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速?

    Parameter Server

    如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速?

    上圖可以很容易看出,AllReduce拓?fù)渲校琑educer節(jié)點成為網(wǎng)絡(luò)傳輸?shù)钠款i。PS拓?fù)渲校ǔC颗_機器啟動相同數(shù)量的Worker和Parameter Server,每臺機器的網(wǎng)絡(luò)傳輸量基本相同。

    ring AllReduce(來自[5])

    如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速?

    對于多機多卡訓(xùn)練,可以把參數(shù)先在本機聚合,再指定一個worker跟參數(shù)服務(wù)器交互,可以大量減少網(wǎng)絡(luò)傳輸。可以使用PaddlePaddle提出來的ring AllReduce,優(yōu)化單機多卡的本地聚合。

    解決瞬間大量的網(wǎng)絡(luò)傳輸問題另一個方法是實現(xiàn)GPU計算和網(wǎng)絡(luò)通信的Overlap。在反向傳播的backward階段產(chǎn)生梯度時,可異步地進(jìn)行梯度更新,并立即計算下一層網(wǎng)絡(luò)的梯度。梯度更新首先要把新梯度從GPU顯存拷貝到CPU內(nèi)存,這種GPU-CPU的拷貝也可以和GPU計算做overlap。因為PS是跑在CPU上,所以GPU計算也跟PS參數(shù)更新實現(xiàn)Overlap。

    GPU計算和網(wǎng)絡(luò)傳輸overlap(來自[1])

    如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速?

    • 消除網(wǎng)絡(luò)瓶頸的方法(二)

    減少網(wǎng)絡(luò)傳輸量也是消除網(wǎng)絡(luò)瓶頸的有效途徑。網(wǎng)絡(luò)模型中90%參數(shù)集中在FC層。很多深度學(xué)習(xí)系統(tǒng)提出了減少FC層參數(shù)大小的方法,比如Adam中的Sufficient Factor,CNTK中的1-bit quantization,Petuum中的Sufficient Factor Broadcasting[7]。

    在PS拓?fù)渲校總€worker需要發(fā)送梯度 如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速? 和接收參數(shù) 如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速? 。SFB通過 如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速?如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速? 轉(zhuǎn)化為兩個低維度矩陣 如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速?如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速? 的傳輸,并采用P2P拓?fù)洌總€worker本地更新參數(shù),避免了參數(shù) 如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速? 的傳輸。SFB和PS比較如下:

    PS和SFB(來自[1])

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    (1)PS使用Master-Server架構(gòu),而SFB使用P2P架構(gòu),每個worker將 如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速?如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速? 發(fā)送給所有其他worker,每個worker通過 如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速?如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速? 在本地更新參數(shù) 如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速? ,從而避免了PS中 如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速? 的傳輸。

    (2)PS每個worker的傳輸數(shù)據(jù)量是固定的,SFB每個worker的傳輸數(shù)據(jù)量跟總worker數(shù)有關(guān),每個worker需要把 如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速?如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速? 發(fā)送給其他worker(發(fā)送numWorkers - 1次)。

    (3)SFB傳輸數(shù)據(jù)量還跟batch size有關(guān)。在非凸有限和問題中

    如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速?如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速? 其中 如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速?如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速?

    在SGD中, 如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速? 表示一個樣本,在mini-batch SGD中, 如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速? 表示batch size個樣本。

    • 實現(xiàn)代碼

    首先得實現(xiàn)PS和SFB,可以參照petuum,ps-lite,angel。

    Tensorflow 相關(guān)的修改主要有兩個地方:

    tensorflow/core/kernels/http://training_ops.cc中的ApplyXXXOp(ApplyGradientDescentOp,ApplyAdagradOp,ApplyMomentumOp等),將本地的梯度更新修改為 發(fā)送 如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速? ->PS端梯度更新->接收 如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速?

    tensorflow/core/kernels/http://matmul_op.cc中的MalMulOp::Compute,這里需要判斷是否使用PS或者SFB,從而將本地更新切換為PS更新或SFB更新。

    本地更新

    如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速?

    PS更新

    如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速?

    SFB更新

    如何實現(xiàn)Tensorflow多機并行線性加速?

    目前我們已經(jīng)復(fù)現(xiàn)[1]中的實驗結(jié)果,實現(xiàn)了Tensorflow多機并行的線性加速。

    參考文獻(xiàn):

    [1]   Hao Zhang, Zeyu Zheng, Shizhen Xu, Wei Dai, Qirong Ho, Xiaodan Liang, Zhiting Hu, Jinliang Wei, Pengtao Xie, Eric P. Xing. Poseidon: An Efficient Communication Architecture for Distributed Deep Learning on GPU Clusters. ATC 2017.

    [2]   C. Sun, A. Shrivastava, S. Singh, and A. Gupta. Revisitingunreasonable effectiveness of data in deep learning era. In arXiv:1707.02968, 2017.

    [3]   Azalia Mirhoseini, Hieu Pham, Quoc V Le, Benoit Steiner, Rasmus Larsen, Yuefeng Zhou, Naveen Kumar, Mohammad Norouzi, Samy Bengio, and Jeff Dean. 2017. Device placement optimization with reinforcement learning. In International Conference on Machine Learning (ICML).

    [4]   PowerAI DDL

    [5] allreduce Bringing HPC Techniques to Deep Learning

    [6]   H. Cui, H. Zhang, G. R. Ganger, P. B. Gibbons, and E. P. Xing. GeePS: Scalable deeplearning on distributed GPUs with a GPU-specialized parameter server. In Proceedings
    of EuroSys, 2016.

    [7]   XIE, P., KIM, J. K., ZHOU, Y., HO, Q., KUMAR, A., YU, Y., AND XING, E. Distributed Machine Learning via Sufficient Factor Broadcasting. In arXiv (2015).

    [8]   HO, Q., CIPAR, J., CUI, H., KIM, J. K., LEE, S., GIBBONS, P. B., GIBSON, G. A., GANGER, G. R., AND XING, E. P. More Effective Distributed ML via a Stale Synchronous Parallel Parameter Server. In NIPS (2013).

    [9]   Benchmarking State-of-the-Art Deep Learning Software Tools

    [10]   NanoNets : How to use Deep Learning when you have Limited Data     

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